El predio de Santa Gertrudis y los predios vecinos suman 28 000 hectáreas y son núcleo de asombrosa diversidad biólogica. De las especies relevantes se encuentran felinos como el jaguar, el ocelote y el leoncillo; también se han identificado reptiles —boas—, y aves como el carpintero de cabeza roja y la garza agamia, importante por el hecho de que el último registro de una colonia en México data de 1961.